Очень странная штука.
Я сам использую D2X - все нормально, никаких проблем с четностью запусков.
Может он у тебя просто не выгружается нормально в те разы когда  он запускается?
Что тут могу сказать - на сайт разработчиков и смотреть bug-tracker (или ждать новой сборки)

Скачал еще одну версию D2X, еще более новую (1.11.23). Зависания вроде бы прекратились, но теперь новая напасть: не отображается на экране счетчик набранных очков. Самое главное - в начале, сразу после установки, он точно был, но после долгих игр с настройками исчез и больше не появляется. Два часа долбился по всем настройкам, но так и не сумел его вернуть. Помогите!
Позже. Вот такие результаты выдаются после завершения 15-го уровня Vertigo:

Shield bonus: 226443500
Energy bonus: 82892050
Hostage bonus: 1500
Skill bonus: 0
Full resque bonus: 3000
Total bonus: 309340050

И самое интересное:

Total score: -840661196

По сравнению с результатом предыдущего уровня счет стал ближе к нулю, так что к концу игры есть шанс даже выйти в плюс.
Интересно, это только у меня одного такая арифметика?

Такое впечатление что выдаются какие-то случайные мусорные данные (это как если не инициализировать переменные в c++ перед выводом их на экран ) А почему есть шанс выйти в плюс - ну раз стартовое значение получилось отрицательное то мало-помалу набранные очки будут все-таки суммироваться.
Короче сломали Вы d2x или нашли какой-то злостный баг. По этому поводу можно написать в форум d2x

Цитата:

Не помню точно - начисляются ли эти бонусы в зависимости от уровня сложности.
помню что skill bonus точно начисляются в зависимости от того на какой сложности играешь.

Частичная победа: автор D2X исправил несколько ошибок, в том числе вернул пропавший счетчик в правый верхний угол экрана. Версия 1.11.35.